全自動固相萃取儀能自動完成固相萃取全過程（柱活化、上樣、柱淋洗、柱干燥、柱洗脫等），自動完成柱切換等功能，實(shí)現(xiàn)批量樣品的處理。然而在使用全自動固相萃取儀時還是需要注意一些注意事項(xiàng)。
1、小心地取出固相萃取裝置，輕放于工作臺上。
2、小心地取出SPE裝置上蓋板(輕拿輕放以免碰壞小管)，將標(biāo)準(zhǔn)試管插入真空倉內(nèi)隔板孔中，然后，將上干蓋板蓋好，并保證蓋板下導(dǎo)流管與試管一一對應(yīng)好，蓋板方形密封圈與真空倉有很好的密封性。如果不易密封，可用橡皮箍箍緊，以增加密封性；
3、如果選購了獨(dú)立調(diào)節(jié)就要先將調(diào)節(jié)閥插入蓋板萃取孔中；
4、如果一次不需要做8個樣品，不用的萃取孔插上針管密閥；
5、如選購了獨(dú)立調(diào)節(jié)閥，全自動固相萃取儀將不用的萃取孔的調(diào)節(jié)閥旋鈕旋到水平密封狀態(tài)；
6、將固相萃取小柱插入到上蓋萃取孔中或閥孔內(nèi)（將調(diào)節(jié)閥旋鈕旋到直立打開狀態(tài)）；用膠管連接萃取裝置和真空泵，擰緊壓力調(diào)節(jié)閥門；
7、將需要萃取的樣品或試劑分別注入到萃取柱中，啟動真空泵，則萃取柱中的樣品將在負(fù)壓力的作用下通過萃取柱流到下面的試管中。此時可通過調(diào)節(jié)減壓閥來調(diào)節(jié)控制液體流速；
8、待針管內(nèi)液體抽完后關(guān)閉真空泵，將富集柱從裝置上拔下，取下裝置上蓋板，拿出試管倒掉；
9、如不想用試管接液，可將試管架取出，全自動固相萃取儀放入合適大小的容器，次萃取后取出倒掉；
10、再將干凈試管放入裝置，蓋好上蓋板，插好SPE小柱，用所需萃取溶劑加入針管，啟動真空泵，至液體抽干后關(guān)掉電源，取出試管備用。萃取制樣完畢；
11、將試管放入氮?dú)獯蹈蓛x中用氮?dú)獯祾邼饪s，制備完畢；
12、處理好試管中的溶劑，并將試管沖洗干凈以備再用；
13、為了節(jié)省SPE柱的使用成本，每次使用后，應(yīng)將SPE柱用淋洗液沖洗干凈，保證其填料的活性。